方舟巨河狸筑巢的方法是：在水中用木头和石头筑起一座水坝，然后在水坝后面筑起一个巢穴。巢穴通常由木头和泥土制成，内部铺满了草和树叶。方舟巨河狸筑巢的目的是为了保护自己和幼崽免受掠食者的侵害，同时也是为了储存食物和筑巢材料。